少年三国志中军团是个很重要的系统，玩家们在创建军团的时候需要注意的是军团中有自带的副本，军团等级每提升1级，会开启一个新的章节，那么军团成员获得的经验和奖励也就更丰富。军团长也可以设定需要攻打的副本，玩家们就可以一起去攻打了。
玩家们每天只有5次挑战军团副本的机会，在每次挑战完成后都可以获得军团贡献哦!军团中的副本都是由6个关卡组成的，最后击杀的玩家可获得额外元宝奖励，每击杀一个关卡，可增加军团经验!然后每天游戏会按全服积分的前30名给予军团的额外奖励。玩家们还可以在军团中讨论打副本的技巧和心得，这样使得每个军团成员都有机会拿到更多的奖励。