口袋妖怪漆黑的魅影三周目神兽大全，迪亚鲁卡：三周目，寝龙镇源初之山顶部的静止之刻。帕鲁奇亚：三周目，寝龙镇源初之山顶部的断空瀑布。基拉帝纳：三周目，抓到超梦后到送神火山塔内顶楼，调查白色墓碑到达反转世界，战胜恶系道馆并捕捉盖诺塞克特后在反转世界尽头遇到。
克蕾塞莉娅：三周目，梦源镇右下角房子睡觉。
达克莱伊：三周目，月魇镇左上角房子睡觉
玛娜菲：三周目光辉之海某处潜水，到深海之殿。
赛伊米：捕获基拉帝纳后的轮回镇一青年处获得冥界之花，再与绿荫镇右下角一女子对话获得感恩之花，最后去二周目缤纷之路的北面的花之海。
阿尔宙斯：捕获迪亚鲁卡，帕鲁奇亚和基拉帝纳，魅影摩天楼全部地区通过后击败艾沃利获得天界之笛，去源初之山顶部创世神殿(身上不得带大师球)。
阿尔宙斯：捕获迪亚鲁卡，帕鲁奇亚和基拉帝纳，魅影摩天楼全部地区通过后击败艾沃利获得天界之笛，去源初之山顶部创世神殿(身上不得带大师球)。
烈希拉姆：三周目，去沉默地下街调查神秘文字后，幻龙之塔左边的现实之间。
捷克罗姆：三周目，去沉默地下街调查神秘文字后，幻龙之塔右边的理想之间。
白色丘雷姆：三周目，抓完烈希拉姆和捷克罗姆并与阿库罗马交谈后，永冻之窟深处的调和之间。
黑色丘雷姆：三周目，抓完烈希拉姆和捷克罗姆并与阿库罗马交谈后，浅滩洞穴深处的调和之间。
凯尔迪奥：三周目谅解之路右边的清澈溪流顶部。
盖诺塞克特：反转世界断罪之间，需打败火箭队前研究员。