《武士大战僵尸2》故事情节沿着上一部而展开，在消灭僵尸之后武士和心爱的妻子过上和平的生活，但是僵尸并没有从此退散，它们抓走了妻子，并且袭击村庄准备把一同武士铲除，于是一场新战斗又打响了。玩家可以在预告片中看到更为精美的动画，游戏在前作的基础上增强了画面细节和音效，依旧以横屏卷轴进行，背景和人物都用立体 3D 画面打造，显示精细而流畅，武士的动作也依旧帅气。
玩家主要控制的是武士，触摸画面的左右两侧分别是前进和后退，武士只要接近敌人就会自动进入战斗，近身的话会挥刀斩击，离得远的话就会射箭(自动远程攻击)。除了普通攻击外，武士还可以装备两种特殊技能，就在画面右下角的技能按键，技能都有冷却时间，图标亮了之后只要点击就能使用。画面上方显示着武士的血槽，被攻击就会损血，不过退至安全地带的话会慢慢回复。
除了一代那只扎尾发的武士之外，《武士大战僵尸 2》新增了三个新英雄：女忍者、巫婆和流浪刀客，每个英雄都拥有各自的独特技能和属性，根据他们的特点或者玩家自己的喜好来选择，在升级选项中，他们的生命值、领导力、武器、技能都拥有各自的发展路线。此外一些其他诸如钟楼、龙卷风、召唤、突击军团等技能被列入为通用技能，所有英雄将共享之。
既然名为塔防游戏，那就不仅仅有主角一人在战斗了。战斗中可以召唤出不同的士兵与自己并肩作战，本作中称为“盟友”。召唤栏就在画面左下角，可召唤的职业随闯关的深入逐渐解锁，最开始我们只能召唤出弱小的农夫，真的很脆皮几乎是砍一刀就挂了。随着我们的武士越来越强，能召唤的兵种也越来越多，甚至还有强力的战国英雄等特殊角色。越往后深入，关卡就越难，只靠武士一个人是难以支撑整个战局的，利用好这些盟友的作用才能带来胜利。
游戏分为单人模式、每日挑战、多人对战模式三种，单人模式就是前一代游戏中的关卡形式。每日挑战则利用丰厚的奖励来激励玩家参与，不过其难度也非常高。最后最具吸引力的是多人模式，该模式下游戏需要玩家主动联网，选择自己一方的英雄同其他玩家相互 PK ，以推倒最后的大门为目标，PK 胜利一方可以带走对方的文物。玩家可以选择随机对手，也可以与指定的好友进行PK。
游戏保留了寿司、碗茶、复活、双倍金币等增益型道具，新增了魂魄/魂魄袋，魂魄会在战斗中击杀掉僵尸后掉落，同样掉落的银币可以用来购买道具升级英雄士兵等，而魂魄则是用来收集文物。文物收集系统是多人模式的附庸系统，因为玩家获取文物的途径只有一个，就是从PK对手身上拿走这些文物，不过首先你得战胜对手。多人游戏的可参与次数取决于玩家的魂魄数量，这在战斗中很容易积累起来，可以重复收集，而且能为玩家带可观的增益效果，尤其在突破高难度关卡中，文物所带来的增益与之相辅相成，系统完备，相辅相成。
总体而言，《武士大战僵尸2》拥有一个前所未有的完备系统，以往过关斩将的单一玩法也变得更多样，而且整体难度也因每日挑战而有所拔高，从画面到内容都已经很超值，玩法上的创新也容易让人接受，虽然内购还是有点多，不过并不影响整体可玩性，喜欢的朋友不要错过。